L’analyse bio-informatique et l’intelligence artificielle appliquées à la gestion et la mise en valeur des données “omics” dans le domaine de la recherche en oncologie.
Le Mardi 22 juin de 13h30 à 17h
au format Digital
Comme chaque année, l’axe 1 du CNO “Médecine de précision des tumeurs solides” organise une rencontre scientifique permettant aux chercheurs et cliniciens d’échanger autour d’une thématique scientifique choisie. Après les thématiques « CRISPR-Cas9, Single Cell » en 2019 et « Organoïdes tumoraux » en 2020, le CNO souhaite cette année faire un état des lieux des compétences présentes au sein du CNO dans ces domaines en pleine expansion
PROGRAMME
13h30 – 13h40 Introduction
13h40 – 14h05 bilille – Plateforme de bioinformatique Lilloise. Jimmy VANDEL, Plateforme bilille – UMS 2014 / US 41 Plateformes Lilloises en Biologie et Santé, Lille
14h05 – 14h30 Bioinformatique pour l’analyse de données de séquençage à haut débit. Hélène TOUZET, CRIStAL, Lille
14h30 – 14h55 L’analyse des variants génétiques rares dans les études d’association à partir des données de séquençage à haut débit. Valentin Harter, Centre de Traitement des Données du Cancéropôle Nord-Ouest, Caen
14h55 – 15h20 Utilisation des barcodes moléculaires (UMI) dans le séquençage de nouvelle génération (NGS). Vincent SATER, LITIS EA 4108, Rouen
15h20 – 15h45 Amélioration de la prédiction bioinformatique des cibles des microARN par l’agrégation des rangs : application au phéochromocytome, une tumeur neuroendocrine. Christophe DUBESSY, Normandie Univ, UNIROUEN, INSERM, PRIMACEN, Laboratoire Différenciation et Communication Neuronale et Neuroendocrine, Rouen
15h45 – 16h10 Caractéristiques profondes globales et locales (Deep-radiomics) en imagerie TEP pour la prédiction de la survie grâce réseau neuronal profond multitâche et multi-échelle. Romain MODZELEWSKI, QUANTIF/LITIS – Centre Henri Becquerel, Rouen
16h10 – 17h00 : Discussions sur les perspectives de recherche en Nord-Ouest
